Il territorio di Perfugas è caratterizzato da un paesaggio ad ampie vallate fluviali, separate da rilievi non elevati e dalle sommità pianeggianti ricche di antiche presenze dell'uomo.
Il paese, 92 m sul livello de mare, poggia, nel suo nucleo più antico, sulla collinetta di Santa Maria, dove si è sviluppato un centro nuragico-romano e medioevale. La raccolta di migliaia di strumenti e manufatti litici hanno permesso di retrodatare la preistoria sarda (le cui attestazioni più antiche erano ferme al VI millennio a.C.) a circa150-200.000 anni a.C.
La creazione nel 1988 del Museo Archeologico e Paleobotanico ha valorizzato il ricco patrimonio archeologico di Perfugas che, oltre alle testimonianze paleobotaniche e paleolitiche, vanta una documentazione quasi senza interruzione culturale che va dal Neolitico Antico al Medioevo.
Tra i monumenti il complesso a domus de janas di Niedda, la domus dell'Ariete in località Funtana Pulida e lo splendido tempio a pozzo ubicato in pieno centro storico.
